Зазвичай хулігани намагаються знайти жертву серед слабких і беззахисних — когось на кшталт Югі Муту. Його прекрасна подруга дитинства, Анзу Мазакі, завжди готова заступитися за нього, але він не може покладатися на неї вічно. Кацуюа Джоунічі, який майже завжди супроводжується своїм словесним суперником Хірото Хондою, також не здається поганою людиною, незважаючи на те, що завжди приносить Югі неприємності. Але найбільше Югі бажає справжнього друга, який зрозуміє його і ніколи не зрадить.

Югі цінує свій Мілленіум Пазл, давній єгипетський артефакт, який потрапив до магазину ігор його діда. Вірячи, що розгадка пазла здійснить його бажання, він завершує пазл, вивільняючи нову особистість у собі — душу "Короля Ігор."

Темний, викривлений, сильний і надійний, нова особистість на ім'я Ямі Югі є повною протилежністю Югі. У випадку будь-якої несправедливості щодо нього, Ямі Югі захоплює тіло Югі і змушує суперника грати в "Тіньову Гру." Ставки високі, адже той, хто програє, відчує темряву, що живе в його власному серці.