Після року в Америці Курісу Макисе повертається до Акібари і зустрічається з Рінтаро Окабе. Однак їхня зустріч переривається, коли Окабе починає відчувати повторювані спалахи інших часових ліній, оскільки наслідки його подорожей у часі починають проявлятися. Ці побічні ефекти врешті-решт призводять до того, що Окабе раптово зникає з світу, і лише здивована Курісу пам'ятає про його існування.

У розпачі Курісу стикається з дійсно важким вибором, який випробує як її обов'язок як науковця, так і її вірність як друга: слідувати порадам Окабе і уникати подорожей у часі, щоб уникнути потенційних наслідків для світових ліній, або ігнорувати це, щоб врятувати людину, яку вона найбільше цінує. Незалежно від її рішення, шлях, який вона обирає, вплине на минуле, теперішнє та майбутнє.