У році Всесвітнього століття 0096, через три роки після невдалої спроби Шара Азнабла примусити людство мігрувати в космос, життя продовжується в колоніях, що обертаються навколо Землі. Одна з таких колоній, на Сайді 4, є домом для Банахера Лінкса, 16-річного хлопця, який веде спокійне життя серед своїх однокласників.

Одрі Берн, остання нащадок великої тиранічної родини, вирішує вкрасти ключ до таємничого пристрою, відомого як "Ящик Лапласа". Кажуть, що Ящик має силу формувати хід всесвіту, і Одрі подорожує на Сайд 4, намагаючись забрати його у його нинішнього власника та не дати його Слівам, що залишилися від Нео-Зеон Шара Азнабла. Під час пошуків вона натрапляє на Банахера і назавжди змінює його життя.

Коли Сайд 4 піддається нападу Слів і їхніх продуктивних бійців Маріди Круз та Фулл Фронтал, Банахер бере під контроль новозбудований Гандама Юнікорн, щоб захистити своїх друзів і врятувати долю людства.