Остання фантазія: Духи всередині

Рік 2065, і планета Земля далеко від того місця, яким вона була в минулому. Смертельні інопланетні істоти, відомі як Фантоми, з'явилися по всій планеті, і простий контакт з цими сутностями є летальним, чи то миттєва смерть, чи тривале занепад. Щоб спробувати врятувати те, що залишилося від людства, навколо певних міст були побудовані великі бар'єри силового поля, щоб відштовхнути Фантомів.

В пошуках більш постійного рішення цієї інвазії є вчені Акі Росс і її наставник, доктор Сід, чиї дослідження виявили, що існує форма духовної енергії Гаї, яка може знищити присутність Фантома в цьому світі. Акі та Сід не самотні у своїй місії через Фінальну Фантазію: Духи Всередині; людська рада та військовий загін "Глибокі Очі" готові допомогти. Але не всі переконані в цьому плані.

Акі, Сід, Грей та їхні союзники повинні об'єднатися проти сил як інопланетних, так і людських, якщо вони хочуть мати хоч якийсь шанс на відновлення миру на Землі. Ворог, дотик якого є фатальним, Фантоми здаються більш небезпечним ворогом, але, як вони дізнаються, їхні людські противники також не є тими, з ким можна жартувати.